但肛瘘因为分泌物堵塞所引起的引流不畅，引起炎症时，造成局部的红肿热痛，同时伴有发烧、寒战、乏力等感染中毒症状时，则应该避免感染加重，可适当的用抗生素和清热解毒、凉血祛瘀、软坚散结的中药，并辅以理疗、外敷中药。

　　一般外敷的中药初期都以消为主，中期以脱离排毒为主。到后期，如果脓肿形成之后，则需要切开引流。