巧克力囊肿的治疗方法它有手术治疗、药物的治疗或者是手术和药物两者相结合的治疗方案。一般来说药物治疗，它主要是通过假绝经的治疗来达到治疗的效果；手术的治疗，它主要是通过切除异位的病灶来达到手术的效果。

　　药物和手术的治疗的效果是最好的，它可以通过手术切除肉眼可见的病灶，同时经过药物的治疗可以消灭残存的肉眼不见的病灶，从而达到更好的治疗效果。