例假即月经，打了HPV第三针来月经一直不干净可能是生理因素导致的，也可能是病理因素导致的，如阴道炎、宫颈息肉等。具体分析如下：

一、生理因素

HPV主要是用于预防人乳头瘤病毒感染所导致的宫颈癌，打了HPV第三针后来月经一直不干净，可能是HPV中所含有的药物成分，对子宫部位产生刺激，但通常在短期内便能够自行缓解。

二、病理因素

1、阴道炎

女性阴道部位通常具有一定的菌群平衡，如果不甚受到外界病菌进入，可能会将平衡打破，引发阴道炎，使患者阴道部位在炎症因子刺激下产生上述症状，可以遵医嘱使用甲硝唑栓、替硝唑片等药物。

2、宫颈息肉

激素水平失衡、宫颈管阻塞、炎症长期刺激等都可能诱发宫颈息肉，使患者宫颈口处产生局限性赘生物，造成黏膜损伤，导致该症状。可以到正规医疗机构，通过息肉切除手术进行治疗。

除此之外，打了HPV第三针来月经一直不干净可能是宫颈炎、子宫内膜炎、子宫内膜息肉等导致的。建议在进行治疗期间忌烟忌酒。