胚囊移植第十二天肚子胀痛，可能是着凉、胚胎着床、排斥反应等因素引起的，需根据实际情况对症处理，具体分析如下：

　　1、着凉

　　胚囊移植主要是将人工干预所形成的胚胎，植入宫腔中，是临床医学上常见的辅助生殖技术。因在操作过程中，可能会对宫颈、子宫内膜等部位造成一定的创伤，因此术后短时间内患者身体较为虚弱，一旦身体受凉，进而造成局部平滑肌收缩，就可能会出现胚囊移植第十二天肚子胀痛的现象。建议可对腹部热敷，通常可以自行缓解。

　　2、胚胎着床

　　若胚胎在宫腔中正常着床，在此过程中，胚胎表面的黏膜与子宫内膜接触，可能会导致子宫内膜少量脱落，出现细小创口，也会产生该症状。建议术后患者不要剧烈的活动，以卧床休息为主。

　　3、排斥反应

　　如果患者子宫内膜容受性比较差，胚胎可能会被身体识别成异常组织，进而产生排斥反应，子宫内膜受到一定刺激，可能会出现频繁收缩的现象，产生上述情况。通常持续时间较短，建议患者不要过度疲劳，保持情绪稳定。

　　除上述原因外，还可能是生化妊娠、移植失败、先兆流产等因素导致的。建议需关注身体的变化，如有阴道异常出血或者疼痛持续时间较长的情况，还需尽早前往医院就医。