川崎病如果没有冠脉的病变，大多数预后良好，复发见于1~2%的患儿。如果有冠脉病变的预后不佳，冠脉损害多发生于病程的2~4周，但也可以发生在疾病的恢复期。

　　心梗和冠脉瘤破裂，可以引起心源性休克甚至猝死。部分冠脉瘤可在病后的两年内自行消失，但常常遗留管壁增厚、弹性减弱等功能异常。大的血管瘤常不易完全消失，可引起血栓形成或管腔狭窄。