新生儿败血症常见的病原菌以金黄色葡萄球菌和大肠杆菌感染为多见。某些条件致病菌如表皮葡萄球菌、绿脓杆菌、克雷白氏杆菌、肠杆菌、变形杆菌、不动杆菌、沙雷菌、微球菌等,以及厌氧菌中的脆弱杆菌、产气夹膜梭菌和耐药菌株等。
新生儿败血症是指病原体侵入婴儿血液并生长、繁殖,产生毒素而造成的全身性反应。病情较为严重,病死率也较高。