停经50天B超看不到孕囊需要到医院去查血HCg，如果是确定怀孕有可能是宫外孕造成，也有可能是排卵不正常引起。如果平常月经不规律，排卵会比较晚，停经50天有时候也看不到孕囊。

　　所以要根据血中的HCG的高度确定怀孕的情况，如果是HCG比较低，有可能是排卵晚的原因，如果是HCG比较高，有可能是宫外孕造成。