子宫腺肌症的具体病因还不是十分清楚,多数学者认为是由于子宫基底层的子宫内膜侵入肌层生长所致。而对于多次怀孕以及分娩、人工流产、慢性子宫内膜炎等,都可以造成子宫内膜基底层的损伤,从而与子宫腺肌病的发病密切相关。
另外子宫腺肌病常合并有子宫肌瘤和子宫内膜增生,表明子宫腺肌病可能与高水平的雌孕激素刺激有关。