手足口病以发热和皮疹为主要的临床表现，潜伏期是3～6天，没有明显的前驱症状。开始症状可能比较轻微，经常被忽视，表现为发热、咽痛、流涕、咳嗽、食欲不振或者精神萎靡等一般感冒的症状。

　　部分小孩子因为口腔有疱疹或者溃疡会出现疼痛的症状，从而流口水比较严重。另外，其发热多发生于皮疹出现之前，体温可以达到38°C～40°C，热型不规则，热程2～7天不等。其体温高度与热程成正比，即体温越高，患者病程越长，而且病情可能越重。

　　少数病例可以出现严重的并发症，如脑膜炎、脑炎、脑脊髓炎、肺水肿、循环衰竭等，病情凶险，可致死亡或留有后遗症。