肾积水的原因有很多，最常见的可能就是先天性肾盂输尿管连接部狭窄，输尿管外的异位血管压迫输尿管，或者是输尿管外的肿瘤压迫输尿管。

　　也可能因为肾、输尿管结石、输尿管自身的狭窄、输尿管肿瘤，也可能因为有膀胱出口梗阻，导致有残余尿，继发性的肾积水。

　　女性怀孕后增大的子宫，压迫输尿管，也会导致肾积水。