室间隔缺损手术的并发症有很多：第一、瘢痕。因为是开刀手术，无论是正中开胸还是右腋侧下开胸，都会出现瘢痕，这种瘢痕是永久性，对身体影响比较大。

　　第二/残余分流。室间隔缺损手术无论是直接缝合还是补片修补，都有可能会出现残余分流现象。残余分流有可能会长时间的残留，导致孩子听诊上会出现心脏杂音。但是绝大多数的残余分流，都可在未来的时间里，自行恢复。如果残余分流比较大，属于3mm、4mm以上的残余分流，则有可能未来需要进行残余分流的封堵手术。

　　第三、心律失常。患者会出现三度房室传导阻滞现象，属于比较严重的并发症，一旦出现此类现象，大部分患者都需要进行永久起搏器植入治疗。