鼻窦炎的感染可能是球菌感染，也可能是杆菌感染。要根据感染的情况，选用敏感的抗生素。球菌感染主要是肺炎链球菌、葡萄球菌或者是卡他莫拉菌的感染。杆菌常常是大肠杆菌或者是大肠埃希菌的感染，有些鼻窦炎可能同时伴有厌氧菌的感染。所以选用抗生素时，可以选用青霉素类的抗生素，也可以选用头孢类的抗生素，必要时可以使用抗厌氧菌的甲硝唑或者替硝唑进行治疗。

　　如果不明确鼻窦炎的细菌，可以做鼻窦炎脓性分泌物的培养。根据培养药敏的试验结果，选用敏感的抗生素治疗效果更好。