肺炎衣原体感染后能否自愈，取决于患者自身的状态。肺炎衣原体感染一般患者症状比较轻微，很少需要住院治疗，如果抵抗力强是可以自愈的。

　　但完全恢复的时间比较长，即使在选择有效抗生素治疗情况下，咳嗽和全身不适在其他症状缓解以后，仍然可以持续一段时间。

　　但是老年患者和有某些慢性疾病的患者，肺炎衣原体肺炎的临床表现可能比较严重，少数甚至有生命危险，所以需要积极治疗。