自身免疫性甲状腺炎包括了桥本甲状腺炎、无痛性甲状腺炎和产后甲状腺炎。其中无痛性甲状腺炎和产后甲状腺炎，有大多数的患者最后会经历甲亢期、甲减期最后恢复成甲状腺功能正常期，因此可以不用治疗。

　　如果出现了典型的甲减的症状，可以给予补充甲状腺激素的治疗，但是最终大多数会转化为正常的甲状腺功能。但是桥本甲状腺炎患者功能可以是正常的，也可以出现桥本甲亢或者桥本甲减，如果出现桥本甲亢则需要给予抗甲状腺药物治疗，如果是桥本甲减，则需要终身使用甲状腺激素的替代治疗。