肺炎支原体对青霉素类及头孢菌素类抗生素不敏感。治疗支原体肺炎主要的药物有：大环内酯类、四环素类，氟喹诺酮类抗菌药物等。因四环素类（如多西环素）、氟喹诺酮类（左氧氟沙星、莫西沙星）是不适合儿童使用，临床上多使用阿奇霉素类的治疗。

　　对于成人支原体肺炎氟喹诺酮类的抗菌药物药效较好。支原体肺炎的疗程一般为10~14天。另外还有对症处理如：镇咳、祛痰以及肺外症状的治疗。本病通常愈后良好。