甲状腺功能减退症可以由甲状腺、垂体、下丘脑的功能异常引起。

　　一、甲状腺发育异常常见于甲状腺缺如或甲状腺发育不全，甲状腺异位等多有家族倾向。

　　二、甲状腺病变。由于甲状腺病变而导致甲状腺分泌不足，主要有甲状腺炎，以慢性淋巴细胞性甲状腺炎为主要原因，产生甲状腺抗体引起甲状腺滤泡破坏，最后激化萎缩所致，称之为特发性甲状腺功能减退。地方性甲状腺走由于缺碘而致甲状腺激素合成障碍，最终也可发展成为甲状腺功能减退，结节病约有10%累积甲状腺，也可致甲状腺激素合成分泌不足，引起甲状腺功能减退。甲亢中的自发性甲减可能系合并自身免疫性甲状腺炎所致。

　　三、下丘脑病变某种原因所致下丘脑功能减退，而引起促甲状腺释放激素减少，最后导致促甲状腺激素、甲状腺激素减少。

　　四、垂体前叶功能减退，由于某种原因，如产后垂体坏死萎缩、肿瘤压迫手术或放射治疗、各种感染及颅内血管病变等，引起垂体前叶功能减退，导致促甲状腺激素及甲状腺激素分泌减少，临床常见于席汉氏病及西蒙氏病。

　　五、其它，如果甲状腺手术切除过多，放射性碘治疗后甲状腺萎缩以及硫脲类抗甲亢药物治疗过量而抑制过氧化物酶阻碍了甲状腺激素的合成。