引起甲减的原因是非常多的，以原发性自身免疫性的损伤最为常见，这一方面最常见的有桥本氏甲状腺炎、萎缩性甲状腺炎、亚急性淋巴细胞性甲状腺炎和产后甲状腺炎。

　　除此之外，还有甲状腺的手术、碘131的治疗、下丘脑和垂体的病变，碘过量，抗甲状腺的药物，如锂盐、硫脲类等，都可以引起甲状腺合成和释放甲状腺激素减少，而引起一系列的多发性的机体低代谢症候群。