肠镜麻醉对身体一般来说是无害的。肠镜麻醉常常使用的是静脉麻醉药或者和镇痛性麻醉药，也一般都是由有资质的麻醉医师在具备麻醉设备及麻醉抢救设备和抢救药物的场合下，才施行肠镜静脉麻醉。

　　所以肠镜静脉麻醉术前必须进行合格的术前禁食以及术前访视，由麻醉医师交代患者一些注意事项，如果患者合并了一些严重的基础疾病，术中可能会增加麻醉并发症，有时甚至会危及生命，但这是非常危重的病人才会有的。普通做肠镜麻醉的患者还是比较安全的。