藿香正气水主要是用来治疗中暑，以及暑湿感冒导致的头晕、恶心、呕吐、腹泻，以及其他的脾胃湿热症状，比如大便粘腻。

　　另外藿香正气水还有许多其他的用途，比如藿香正气水外涂可以治疗灰指甲，藿香正气水还可以治疗晕车。藿香正气水还可以治疗蚊虫叮咬，被蚊虫叮咬以后，涂上藿香正气水就可以达到很快的止痒的效果。