黄体酮低的原因并不是很明确，正常黄体机能的维持与下丘脑到垂体到卵巢性腺轴功能有关。

　　当出现黄体酮功能不全的时候，多考虑与垂体分泌的黄体生成术、促卵泡生成素有关系，催乳素过多或者是过少，以及软泡本身不成熟，对促性腺激素不敏感有关系。另外黄体本身合成的孕激素不足与雌激素之间的比例不协调等等，都有可能出现黄体酮低。