子宫内膜异位症患者不孕率高达40%左右，引起不孕的原因很多，比如说盆腔微环境的改变，影响了精子、卵子的结合以及运送。免疫功能异常，导致抗子宫内膜抗体增加，而破坏了子宫内膜正常代谢和生理功能。

　　卵巢功能异常导致了排卵障碍和黄体形成不良。中重度患者可以因为卵巢、输卵管周围粘连而影响受精卵的运输。