结膜炎的治疗原则是应该根据结膜炎的病因来进行治疗。滴眼液是治疗结膜炎最基本的方法，微生物性结膜炎应该选用抗生素和抗病毒滴眼液。

　　必要的时候应该根据病原体培养和药敏实验来选择用药，严重的患者可以使用一些药敏实验，选择多种眼药水和药膏进行联合性的治疗，急性期应该经常使用眼药水，每1~2个小时使用一次，病情好转之后可以减少眼药水的次数。