自闭症的病因尚不明确，可能跟以下因素有关。

　　一、遗传。 遗传因素对自闭症的作用已趋于明确，但具体的遗传方式还不明了。

　　二、围生期因素。 围生期出现各种并发症，如产伤、宫内窒息等，其发生率较正常对照多。三、免疫系统异常。自闭症者检查发现存在T淋巴细胞数量减少，辅助T细胞和B细胞数量减少，自然杀伤细胞活性降低等。

　　四、神经内分泌和神经递质。与多种神经内分泌和神经递质功能失调有关。