腹腔镜手术除了跟传统的开刀手术有共同的并发症以外，还有部分特有的并发症。其共有的并发症包括腹壁戳孔、戳孔疝、戳孔出血等，为了手术操作的空间，腹腔镜手术需要充二氧化碳这种惰性的气体把腹腔撑起来。因为二氧化碳本身是一种酸性气体，虽然麻醉时都用呼吸机往外排二氧化碳，但是时间长会出现酸中毒等。

　　其特有的一并发症，包括出血、副损伤等。随着时间延长，大部分腹腔镜手术的医生学习掌握的熟练程度成熟，共有和特有的并发症的发生率已经逐渐下降。