甲减原因比较复杂，分为先天性和后天性。先天性甲减是指出生之前就存在甲状腺功能减退，这是往往和遗传和宫内发育是有关。

　　后天性甲减根据发病部位又可以分为原发性甲减、继发性甲减和散发性甲减。其中，原发性甲减最为常见，通常是由于桥本氏甲状腺炎所导致。

　　此外，甲状腺手术、碘-131治疗以及药物治疗等，也会导致原发性甲减发生。