在临床上肛瘘主要是导致患者出现反复的肛旁肿痛，同时也会出现反复的流脓血水的症状，而且伴有恶臭味，严重的会影响患者的正常生活。同时肛周部位可能会出现肛门湿疹，导致肛门皮肤瘙痒不适，这个主要是由于长期的脓性分泌物刺激肛周皮肤引起的。而且部分患者如果存在高位复杂性肛瘘，那么肛周部位的外口则会出现多个，甚至会导致患者坐卧难安，甚至出现贫血、身体消瘦等不适，对此建议尽早采取肛瘘手术切除治疗。