由于肛瘘是由内口、瘘管以及外口组成，肛瘘一般是建议采取手术治疗，只有清除干净内口以及瘘管才能达到根治的效果。如果肛瘘不采取手术治疗，单纯的选择药物进行保守治疗，只能暂时缓解临床症状。

　　甚至可能导致后期瘘管越来越多，形成高位复杂性肛瘘，这样的话则会增加手术的难度，而且对于肛门括约肌的损伤会更加大。所以在临床上一旦发现肛瘘，建议立即采取手术治疗。