化脓性扁桃体炎常见的致病菌是溶血性链球菌、流感嗜血杆菌、肺炎链球菌和葡萄球菌。链球菌是最多见的，经常好发于青少年、幼儿，经常会达到40度的体温，一般口服抗生素很难压下来，往往需要输液治疗。化脓性扁桃体炎因为经常是链球菌感染，所以往往会合并一些心肌炎、风湿热、类风湿关节炎或者风湿性心脏瓣膜病等疾病。