如果囊肿较小，不需要经过特殊治疗。如果囊肿较大，引起屈伸障碍或者小腿出现相关症状，患者需要通过手术去除腘窝囊肿。但是腘窝囊肿也可能不单纯是疾病，多发生于骨性关节。如果存在骨性关节原发疾病，腘窝囊肿有复发机会，并且可能性很高。

　　如果是半月板囊肿，患者需要进行关节镜，松解半月板囊肿。因为半月板囊肿和腘窝囊肿有所不同，需要根据轻重程度明确下一步治疗方式。