巧克力囊肿一般情况下是良性的，恶性病变的几率也有，但是恶变的几率不会很高。

　　如果发现巧克力囊肿以后，可以尽快及时的手术切除，手术切除以后还应该尽量注意复查，因为巧克力囊肿复发的几率是比较高的，如果总是频繁的复发，那就会容易有恶变的几率，应该尽快采取治疗措施，控制病情的发展。