长子宫肌瘤的原因目前尚不十分清楚，医学角度有两个学说，一个是细胞遗传学，一个是分子生物学。细胞遗传学认为子宫肌瘤存在着细胞遗传学的异常，包括12号染色体、17号染色体和7号染色体的相互换位和长臂缺失以及长臂的重排。分子生物学认为子宫肌瘤是由单克隆平滑肌细胞繁殖增多而形成的。肌细胞当中雌激素受体和组织中雌二醇含量较正常，子宫肌组织增高，雌激素可以促进子宫肌瘤的增大，因此认为此激素的增高波动与子宫肌瘤的生长发生有一定的相关性。