首先脑干是属于脑组织的一部分，所以脑干梗塞是属于脑梗塞的一个部分。也就是说脑梗塞包括了脑干梗塞，这就是两者的区别。不管是脑干梗塞还是脑梗塞，其大的治疗原则就是需要早期明确脑梗塞的诊断，因为对于脑梗塞的治疗，尤其需要注意其发病的时间窗。因为如果在时间窗内进行有效的治疗，患者的预后有可能会不错。如果错过了时间窗，那么患者有可能病情发生急剧的变化。