首先肛肠疾病在临床上有很多种，针对不同的疾病，其预防措施是不一样的，但是对于肛肠疾病的大多数患者，其预防首先必须保持良好的饮食习惯，比如多饮水、多吃蔬菜、多吃富含膳食纤维的食物。同时，可以定期去肛肠科就诊，发现早期存在的病变，早期进行医学干预。其次，要忌烟酒、忌辛辣饮食、养成良好的排便习惯，这样可以预防比如痔、肛裂、肛周脓肿、肛周感染性疾病的发生。

比如对于肛门直肠性病，因为其发生最主要就是通过性传播而导致。预防上最主要就是要洁身自好。对于肛门直肠损伤的患者，预防上就是预防肛门部发生损伤。