腺肌症指子宫内膜腺体和间质存在于子宫肌层中，它的病因目前到现在还不清楚。但是多数专家认为子宫腺肌症是基底层内膜细胞增生，然后侵入到了基层间质的结果。另外遗传、子宫内膜基底层损伤、高雌激素血症以及病毒的感染跟这个疾病有非常大的关系，尤其是体内的雌激素水平比较高与子宫腺肌症的关系非常重要。

子宫内膜基底层的损伤，比如有多次的怀孕、刮宫以及剖腹产，还有慢性的子宫内膜炎都有可能会导致的。