在男性生殖道感染主要是进行尿道炎和前列腺炎的鉴别。前列腺炎分为细菌性前列腺炎和非细菌性前列腺炎，可以通过肛门直肠指诊、按摩前列腺，取前列腺液进行检查，如果前列腺液当中有明显的白细胞和细菌感染，证实是细菌性前列腺炎，那么需要进行抗生素对症治疗，而尿道炎主要是进行淋球菌性尿道炎和非淋球菌性，也就是普通细菌感染的尿道炎进行鉴别诊断。都需要使用抗生素进行对症治疗。而对于女性主要是对阴道炎进行鉴别，看是真菌性阴道炎还是细菌性阴道炎或者滴虫性阴道炎，可以通过阴道分泌物涂片检查以及进行细菌、真菌培养，如果证实是哪一种阴道炎存在，可以进行对症的药物治疗。