对于肾脏结石和输尿管结石具体形成原因，目前仍不明确，是一个多因素复杂、综合的结果，因为结石主要成分是草酸钙，因此与尿液当中钙和草酸含量过饱和有关。

与患者的平时饮食饮水以及生活习惯和基因遗传等都有可能相关，而不同的地域不同的种族肾结石发病率也会有差异，对于输尿管结石原发性的很少，主要是由于肾脏结石掉落到输尿管当中所致，这是输尿管结石形成的最主要原因。