骨髓异常增生综合症的病因目前尚未完全的明确。主要发现的一些是引起这个病的危险因素。

比如说电离辐射强的电子厂，还有细胞毒性的化疗药物以及长期的接触有机溶剂，重金属染发剂等等。这些也是有可能导致癌变的一些因素。这些因素是外在的因素，另外还有一些是人体内在的因素，比如说多种免疫功能的异常等等。

这些都是有可能导致骨髓异常增生综合征的原因。