对于泌尿系结石具体产生的原因，目前机制仍然不是很明确，对于结石主要分为原发性病因和继发性病因，特别是原发性病因仍然不明，主要和患者本身体内代谢和基因遗传饮食和居住环境、种族等等相关。而对于继发性结石，主要在小儿当中膀胱结石，目前和营养不良有关，感染性结石和反复发作的泌尿系感染相关，对于尿道狭窄的患者也会导致膀胱结石，这是目前继发性结石形成的主要原因。在老年男性前列腺增生重度的患者当中，由于下尿路梗阻，从而会导致膀胱结石。