小儿心肌炎的临床表现，往往是不同的。它有轻重之分而且变化多端。多数是在感冒发烧之后出现的。其主要的表现为，急剧发病，严重者可出现烦躁不安、呼吸窘迫、皮肤苍白，这样的表现形式是酷似肺炎。

也可以出现一些非特异性的症状，比如发热、嗜睡、呕吐、腹泻、黄疸，继而出现呼吸窘迫。 新生儿表现会相对于更加严重一点。比如出现严重的心输出量不足。

表现为脸色苍白、多汗。肢体冷、体温不升，还容易形成充血性心力衰竭为呼吸急促伴有呻吟、喘憋、三凹征、肝脾肋下肿大、有水肿，严重者可出现大脑损伤。

婴幼儿心肌多数由手足口病毒肠道感染性病毒所诱发。往往症状不典型，患儿出现嗜睡、烦躁等症状。总是表现为无力，此时需要查心肌酶。如果有明显的损伤，需要及时的给予果糖二磷酸钠注射或者是口服来进行处理。

还有一些患儿会出现神经系统的表现，比如颈抵抗或者是惊厥。脑积液检查可发现单核细胞增多，有助于该病的早期诊断。