一般治疗主要是保持健康的生活习惯、健康饮食、适量运动，避免烟酒或刺激性食物的刺激，还可根据患者不同的特点给予相应的心理治疗。

主要根据患者具体症状给予相应治疗。如功能性消化不良，可给与抑制胃酸分泌药来缓解上腹痛症状，给予促胃肠动力药来缓解上腹胀、早饱、嗳气症状；腹泻的给予止泻药等