内分泌性高血压不同的疾病鉴别如下：

垂体瘤主要是与下丘脑垂体区域的垂体瘤引起鞍区扩大的疾病。包括颅咽管瘤、淋巴细胞性垂体炎、生殖细胞瘤、脑膜瘤、淋巴瘤、白血病及转移性瘤等进行鉴别。

嗜铬细胞瘤需要与神经官能症，绝经期综合征，少数以代谢紊乱为主要表现的与甲亢，糖尿病相鉴别，还需要与肾上腺髓质增生鉴别。

原发性醛固酮增多症需要与继发性醛固酮增多症和非醛固酮所致盐皮质激素过多综合征相鉴别。

皮质醇增多症及库欣综合症需要和抑郁症、乙醇相关性库欣综合征、遗传性全身性糖皮质激素不敏感综合征、单纯性肥胖、二型糖尿病、神经性厌食、多囊卵囊卵巢综合症进行鉴别。

甲状腺功能亢进症需要与单纯性甲状腺肿、嗜铬细胞瘤、神经官能症以及结核、糖尿病、桥本甲状腺炎、恶性肿瘤、慢性结肠炎等疾病想鉴别。

甲状旁腺功能亢进症，有骨破坏合并血钙升高的需要与多发性骨髓瘤、肿瘤溶骨性转移、假性甲状旁腺功能亢进进行鉴别。

还需要与结节病、良性家族性高钙血症、维生素A、维生素D过量以及原发性骨质疏松、骨质软化症和肾性骨营养不良进行鉴别。