抗精子抗体阳性主要引起的并发症是不孕不育和流产。

在不孕不育疾病中，不论是男性还是女性都有可能会出现抗精子抗体阳性。对于男性而言，抗精子抗体阳性主要表现为男性的精子质量下降，存活率不达标并且精子活力下降。对于女性而言，抗精子抗体阳性，指的是男性的精子进入女性子宫之后，会被女性的免疫细胞误认为是异物侵入人体，而被清除掉。抗精子抗体与宫颈粘液蛋白结合，可阻止精子穿过宫颈粘液；抗精子抗体可干扰精子获能与顶体反应，影响精子的运动。细胞毒作用，吞噬精子；抗精子抗体能阻止精卵结合，引起补体介导的受精卵的溶解，损害胚胎植入及前期胚胎发育，导致早期流产。早期胚胎上也有精子抗原，抗精子抗体与之反应并借助补体、巨噬细胞和杀伤细胞来杀伤受精卵和早期胚胎，从而导致流产。