在临床上慢性附睾炎应该与以下几种疾病相鉴别：一、慢性附睾炎应该与附睾结核相鉴别，二者有时在临床上很难鉴别，应该详细地询问患者有无泌尿系统的结核病史，附睾结核早期病变局部在附睾的尾部，最后累及到整个附睾，输精管处呈现串珠样的改变，同时精囊肿大、变硬，阴囊的皮肤常与附睾粘连，有的时候会形成一个慢性的窦道；

二、慢性附睾炎应该与附睾的肿物相鉴别：1、附睾的囊肿，多数附睾的囊肿患者，首先发现的是附睾局部的肿物，偶有不适，同时还有睾丸附睾的肿瘤以及附睾的囊肿鉴别，一定要通过超声诊断来进行系统的临床鉴别