急性淋菌性精囊炎的治疗，主要是使用抗生素进行治疗，对于有并发症或者病情较重的患者，应当增加药物的治疗剂量和延长治疗的时间，常使用头孢类的抗生素进行治疗，如头孢曲松钠。

如果患者对头孢类抗生素过敏，可以改用大观霉素肌注进行治疗，也可以使用环丙沙星口服治疗，但是对于肝肾功能较差的患者和年龄在18周岁以下的患者，环丙沙星是禁止使用的。