急性淋菌性精囊炎，多是由于淋菌性尿道炎未能及时的治疗而引起的。

急性期淋球菌经尿道口进入尿道，侵入尿道黏膜上皮细胞，并在细胞内繁殖造成急性炎症，有大量白细胞聚集在炎症部位，淋球菌被白细胞吞食死亡放出内毒素，以致尿道黏膜发生坏死产生大量的脓性分泌物，由尿道口排出，后期病变向后尿道扩散，导致淋菌性精囊炎。