治疗目的在于改善症状、减少合并症和预防猝死。其方法是通过减轻流出道梗阻、改善心室顺应性、防治血栓塞事件、识别高危猝死病人。治疗需要个体化。药物治疗是基础，针对流出道梗阻的药物主要有贝他受体拮抗剂和非二氢吡啶类钙通道阻断剂。贝他受体拮抗剂是一线药物，非二氢吡啶类钙通道阻断剂对减轻左心室流出道梗阻有一定效果，不能耐受贝他受体拮抗剂的可选择使用，当出现充血性心力衰竭时需要采用针对性处理，可选择血管紧张素转化酶抑制剂，贝他受体拮抗剂，利尿剂等，对房颤病人需要抗凝治疗，可选择胺碘酮减少阵发性房颤的发生，持续性房颤可选择贝他受体拮抗剂。避免使用硝酸酯类药物,以免使用后加重。

非药物治疗包括手术治疗，酒精室间隔消融术，起搏治疗等。心律转复除颤器能有效预防猝死。