脊柱关节炎的发病原因尚不完全明了。目前研究认为，环境因素与遗传因素（易感性）是导致SpA发病的两个重要因素。1.遗传因素 研究发现，脊柱关节炎与HLA-B27有密切关联。AS患者中HLA-B27阳性率高达90％～95％，RS或ReA为60％～80％，PsA为50％，而正常人群中HLA-B27阳性率仅为4％～8％。在HLA-B27阳性的AS患者一级亲属中，有10％～27％HLA-B27阳性的成年人患AS，因此认为HLA-B27与SpA密切相关。但HLA-B27并非直接致病原因，而是这组疾病的易感基因。2.环境因素。环境因素中感染最为重要。肠道和泌尿道感染后可引起RS，福氏志贺痢疾杆菌、沙门菌属、耶尔森菌和幽门螺杆菌感染可导致ReA，肠道肺炎克雷伯杆菌感染与AS相关。