目前没有明确的治疗方案治疗薄基底膜肾病，对于良性过程中的患者无需特殊治疗，对于出现高血压、蛋白尿等情况的患者，可用药治疗。

对于单纯血尿，而无高血压和肾功能损害者，无需特殊治疗，但要避免感冒、各种感染、过度劳累，以及使用肾损害的药物，定期检测血压和肾功能，避免不必要的治疗，导致药物对肾的毒性作用。

每年对患有薄基底膜肾病的患者进行高血压、蛋白尿和肾功能损害的检查。出现蛋白尿或血压升高需给予药物ACEI治疗，ACEI可延缓发生肾功能衰竭并延长寿命。极少数患者伴有大量蛋白尿或肾病综合征，可用糖皮质激素治疗。