若马拉色菌毛囊炎的数量比较少，病情比较轻，可能会在注意局部卫生、加强卫生管理的情况下随着皮肤的自我修复能力逐渐恢复，甚至自愈，不要进行特殊治疗。

　　但是，马拉色菌毛囊炎的病情有一定的个体差异。若病情比较严重，则需要通过治疗控制病症，如可以考虑局部外用酮康唑乳膏、克霉唑乳膏等咪唑类药物或者特比奈芬乳膏等丙烯胺类药物，也可以考虑口服氟康唑等抗真菌药物进行全身治疗，加强抗菌效果。

　　但是马拉色菌难以永久清除，所以疾病容易反复发作。平时要注意个人卫生，尽量穿透气性好的衣物，避免过度摩擦和刺激皮肤。