牙源性上颌窦炎急性期可以使用抗生素，要进行细菌培养及药敏实验选择敏感的抗生素，在没有明确敏感抗生素之前可以选择广谱抗生素，如阿莫西林、二代头孢。抗生素治疗要足量足疗程，防止细菌对于抗生素耐药，防止因为治疗不彻底引起慢性上颌窦炎。

　　急性期症状较重者可以使用盐酸萘甲唑啉、麻黄碱类药物。鼻部过敏性症状比较严重，可以服用抗组胺药物，比如氯雷他定、西替利嗪、马来酸氯苯那敏片等。

　　如果是慢性上颌窦炎，可以选择鼻用糖皮质激素治疗，还可以口服泼尼松用于全身治疗。